Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3aP23116 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3aP23116 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3aP23116 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3aP23116 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3aP23116 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3aP23116 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3aP23116 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3aP23116 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3aP23116 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Eif3aP23116 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3aP23116 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Eif3aP23116 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Eif3aP23116 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Eif3aP23116 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3aP23116 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3aP23116 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3aP23116 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3aP23116 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Eif3aP23116 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3aP23116 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Eif3aP23116 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3aP23116 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3aP23116 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3aP23116 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3aP23116 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3aP23116 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3aP23116 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3aP23116 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3aP23116 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3aP23116 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3aP23116 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3aP23116 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3aP23116 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3aP23116 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Eif3aP23116 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3aP23116 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3aP23116 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3aP23116 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3aP23116 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3aP23116 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3aP23116 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3aP23116 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3aP23116 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3aP23116 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3aP23116 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3aP23116 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Eif3aP23116 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3aP23116 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3aP23116 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3aP23116 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Eif3aP23116 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3aP23116 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3aP23116 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3aP23116 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3aP23116 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3aP23116 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3aP23116 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Eif3aP23116 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3aP23116 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3aP23116 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3aP23116 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3aP23116 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3aP23116 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3aP23116 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3aP23116 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3aP23116 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3aP23116 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3aP23116 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3aP23116 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Eif3aP23116 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Eif3aP23116 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Eif3aP23116 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Eif3aP23116 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Eif3aP23116 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Eif3aP23116 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Eif3aP23116 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Eif3aP23116 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Eif3aP23116 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Eif3aP23116 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Eif3aP23116 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Eif3aP23116 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Eif3aP23116 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Eif3aP23116 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Eif3aP23116 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Eif3aP23116 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Eif3aP23116 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Eif3aP23116 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Eif3aP23116 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Eif3aP23116 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Eif3aP23116 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Eif3aP23116 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Eif3aP23116 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Eif3aP23116 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Eif3aP23116 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Eif3aP23116 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Eif3aP23116 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Eif3aP23116 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Eif3aP23116 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Eif3aP23116 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms