Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RarbP22605 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RarbP22605 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RarbP22605 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RarbP22605 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RarbP22605 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RarbP22605 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RarbP22605 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RarbP22605 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RarbP22605 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RarbP22605 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RarbP22605 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RarbP22605 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RarbP22605 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RarbP22605 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RarbP22605 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RarbP22605 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RarbP22605 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RarbP22605 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RarbP22605 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RarbP22605 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RarbP22605 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RarbP22605 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RarbP22605 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RarbP22605 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RarbP22605 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RarbP22605 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RarbP22605 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RarbP22605 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RarbP22605 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RarbP22605 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RarbP22605 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RarbP22605 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RarbP22605 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RarbP22605 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RarbP22605 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RarbP22605 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RarbP22605 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RarbP22605 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RarbP22605 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RarbP22605 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RarbP22605 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RarbP22605 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RarbP22605 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RarbP22605 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RarbP22605 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RarbP22605 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RarbP22605 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RarbP22605 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RarbP22605 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RarbP22605 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RarbP22605 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RarbP22605 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RarbP22605 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RarbP22605 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RarbP22605 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RarbP22605 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RarbP22605 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RarbP22605 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RarbP22605 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RarbP22605 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RarbP22605 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RarbP22605 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RarbP22605 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RarbP22605 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RarbP22605 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RarbP22605 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RarbP22605 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RarbP22605 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RarbP22605 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RarbP22605 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RarbP22605 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RarbP22605 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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