Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb9P20615 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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