Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrkcaP20444 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms