Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ntf3P20181 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ntf3P20181 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms