Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
P20040 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
P20040 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
P20040 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
P20040 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
P20040 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
P20040 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
P20040 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
P20040 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
P20040 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P20040 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P20040 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P20040 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P20040 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P20040 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P20040 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P20040 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
P20040 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P20040 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
P20040 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P20040 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
P20040 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
P20040 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
P20040 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P20040 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
P20040 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P20040 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P20040 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P20040 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
P20040 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
P20040 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
P20040 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
P20040 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
P20040 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
P20040 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
P20040 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
P20040 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
P20040 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
P20040 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
P20040 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P20040 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
P20040 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P20040 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P20040 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
P20040 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P20040 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P20040 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P20040 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P20040 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P20040 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P20040 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
P20040 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P20040 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P20040 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P20040 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
P20040 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P20040 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P20040 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P20040 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P20040 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P20040 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P20040 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
P20040 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P20040 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
P20040 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
P20040 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P20040 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P20040 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P20040 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
P20040 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
P20040 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
P20040 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
P20040 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
P20040 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
P20040 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
P20040 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
P20040 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
P20040 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P20040 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
P20040 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
P20040 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
P20040 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
P20040 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
P20040 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
P20040 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P20040 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P20040 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
P20040 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P20040 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P20040 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
P20040 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P20040 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P20040 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
P20040 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P20040 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P20040 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P20040 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
P20040 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P20040 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P20040 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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