Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18528 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18528 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
P18528 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
P18528 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18528 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18528 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18528 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18528 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18528 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18528 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18528 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18528 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18528 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18528 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18528 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
P18528 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
P18528 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
P18528 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18528 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18528 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18528 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18528 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18528 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18528 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18528 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18528 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18528 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18528 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18528 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18528 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18528 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18528 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18528 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18528 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18528 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18528 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18528 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18528 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18528 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18528 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18528 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18528 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18528 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18528 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18528 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18528 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18528 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18528 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18528 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18528 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18528 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18528 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
P18528 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
P18528 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18528 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18528 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
P18528 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18528 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18528 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18528 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18528 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18528 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18528 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18528 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18528 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18528 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18528 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18528 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18528 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18528 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18528 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18528 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18528 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18528 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18528 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18528 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18528 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18528 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
P18528 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
P18528 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
P18528 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
P18528 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
P18528 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
P18528 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
P18528 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
P18528 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
P18528 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC9.71□□□□□ -0.85
P18528 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
P18528 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
P18528 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
P18528 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
P18528 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
P18528 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
P18528 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
P18528 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
P18528 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
P18528 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
P18528 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
P18528 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms