Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PcnaP17918 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PcnaP17918 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PcnaP17918 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PcnaP17918 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PcnaP17918 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PcnaP17918 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PcnaP17918 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PcnaP17918 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PcnaP17918 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms