Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Ifnb1-201ENSMUST00000055671 750 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Olfr1233-201ENSMUST00000099784 1042 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa-rs1P17533 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa-rs1P17533 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms