Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Kalrn-203ENSMUST00000114947 2922 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Trpm1-201ENSMUST00000085222 5711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Tsc2-203ENSMUST00000226284 6266 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms