Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ItgamP05555 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ItgamP05555 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ItgamP05555 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ItgamP05555 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ItgamP05555 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ItgamP05555 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ItgamP05555 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ItgamP05555 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ItgamP05555 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ItgamP05555 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ItgamP05555 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms