Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BlmO88700 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BlmO88700 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BlmO88700 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BlmO88700 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BlmO88700 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BlmO88700 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BlmO88700 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BlmO88700 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BlmO88700 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BlmO88700 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BlmO88700 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
BlmO88700 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BlmO88700 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
BlmO88700 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
BlmO88700 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
BlmO88700 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BlmO88700 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BlmO88700 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BlmO88700 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BlmO88700 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BlmO88700 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BlmO88700 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BlmO88700 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
BlmO88700 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BlmO88700 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BlmO88700 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BlmO88700 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BlmO88700 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BlmO88700 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BlmO88700 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BlmO88700 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BlmO88700 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BlmO88700 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BlmO88700 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BlmO88700 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BlmO88700 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BlmO88700 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BlmO88700 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BlmO88700 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BlmO88700 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BlmO88700 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BlmO88700 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BlmO88700 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BlmO88700 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BlmO88700 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BlmO88700 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BlmO88700 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BlmO88700 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BlmO88700 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BlmO88700 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BlmO88700 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BlmO88700 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BlmO88700 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BlmO88700 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BlmO88700 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BlmO88700 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BlmO88700 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BlmO88700 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BlmO88700 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BlmO88700 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BlmO88700 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BlmO88700 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BlmO88700 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BlmO88700 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BlmO88700 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BlmO88700 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BlmO88700 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
BlmO88700 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BlmO88700 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
BlmO88700 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BlmO88700 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BlmO88700 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
BlmO88700 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
BlmO88700 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BlmO88700 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BlmO88700 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BlmO88700 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BlmO88700 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BlmO88700 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BlmO88700 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BlmO88700 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BlmO88700 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
BlmO88700 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BlmO88700 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BlmO88700 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BlmO88700 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BlmO88700 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BlmO88700 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BlmO88700 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BlmO88700 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BlmO88700 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BlmO88700 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BlmO88700 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BlmO88700 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BlmO88700 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BlmO88700 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BlmO88700 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BlmO88700 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BlmO88700 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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