Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfdp1O88271 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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