Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Opn1mwO35599 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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