Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clk2O35491 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clk2O35491 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clk2O35491 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Clk2O35491 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clk2O35491 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clk2O35491 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clk2O35491 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clk2O35491 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clk2O35491 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
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Clk2O35491 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Clk2O35491 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Clk2O35491 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Clk2O35491 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clk2O35491 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clk2O35491 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clk2O35491 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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