Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Prrt1O35449 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Prrt1O35449 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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Prrt1O35449 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Prrt1O35449 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Prrt1O35449 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms