Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ColqO35348 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ColqO35348 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ColqO35348 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm21542-201ENSMUST00000182307 993 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm37727-201ENSMUST00000191637 819 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ColqO35348 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm37676-201ENSMUST00000195496 507 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm8952-201ENSMUST00000206828 1102 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ColqO35348 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ColqO35348 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ColqO35348 AC160030.1-201ENSMUST00000218916 506 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ColqO35348 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ColqO35348 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm5142-201ENSMUST00000066558 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ColqO35348 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ColqO35348 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ColqO35348 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ColqO35348 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ColqO35348 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ColqO35348 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ColqO35348 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ColqO35348 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ColqO35348 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ColqO35348 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ColqO35348 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ColqO35348 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ColqO35348 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm14480-201ENSMUST00000118521 433 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm6806-201ENSMUST00000120092 1006 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 Sp3os-203ENSMUST00000137941 628 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 4930430E12Rik-201ENSMUST00000139214 901 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 Plgrkt-208ENSMUST00000143467 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm13184-201ENSMUST00000149932 626 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm16537-201ENSMUST00000161529 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm45733-201ENSMUST00000212988 437 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ColqO35348 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 1700080N15Rik-202ENSMUST00000154360 1316 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ColqO35348 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
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