Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms