Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
MttpO08601 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
MttpO08601 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
MttpO08601 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
MttpO08601 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
MttpO08601 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
MttpO08601 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
MttpO08601 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
MttpO08601 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
MttpO08601 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
MttpO08601 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
MttpO08601 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
MttpO08601 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
MttpO08601 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
MttpO08601 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
MttpO08601 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
MttpO08601 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
MttpO08601 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
MttpO08601 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
MttpO08601 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
MttpO08601 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
MttpO08601 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
MttpO08601 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
MttpO08601 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
MttpO08601 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
MttpO08601 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
MttpO08601 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
MttpO08601 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
MttpO08601 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
MttpO08601 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
MttpO08601 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
MttpO08601 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
MttpO08601 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
MttpO08601 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
MttpO08601 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
MttpO08601 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
MttpO08601 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
MttpO08601 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
MttpO08601 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
MttpO08601 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
MttpO08601 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
MttpO08601 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
MttpO08601 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
MttpO08601 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
MttpO08601 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
MttpO08601 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
MttpO08601 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
MttpO08601 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
MttpO08601 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
MttpO08601 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
MttpO08601 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
MttpO08601 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
MttpO08601 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
MttpO08601 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
MttpO08601 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
MttpO08601 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
MttpO08601 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
MttpO08601 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
MttpO08601 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
MttpO08601 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
MttpO08601 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
MttpO08601 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
MttpO08601 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
MttpO08601 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
MttpO08601 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
MttpO08601 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
MttpO08601 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
MttpO08601 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
MttpO08601 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
MttpO08601 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
MttpO08601 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
MttpO08601 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
MttpO08601 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
MttpO08601 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
MttpO08601 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
MttpO08601 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
MttpO08601 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
MttpO08601 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
MttpO08601 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
MttpO08601 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
MttpO08601 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
MttpO08601 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
MttpO08601 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
MttpO08601 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
MttpO08601 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
MttpO08601 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
MttpO08601 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
MttpO08601 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
MttpO08601 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
MttpO08601 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
MttpO08601 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
MttpO08601 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
MttpO08601 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
MttpO08601 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
MttpO08601 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
MttpO08601 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
MttpO08601 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
MttpO08601 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
MttpO08601 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
MttpO08601 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms