Protein–RNA interactions for Protein: L7N2C4

Gm4340, Predicted gene 4340, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4340L7N2C4 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm4340L7N2C4 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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