Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2035J3QP87 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms