Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc180J3QNE4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc180J3QNE4 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc180J3QNE4 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc180J3QNE4 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc180J3QNE4 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc180J3QNE4 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc180J3QNE4 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc180J3QNE4 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc180J3QNE4 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc180J3QNE4 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc180J3QNE4 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc180J3QNE4 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc180J3QNE4 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc180J3QNE4 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc180J3QNE4 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc180J3QNE4 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc180J3QNE4 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc180J3QNE4 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc180J3QNE4 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc180J3QNE4 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc180J3QNE4 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc180J3QNE4 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc180J3QNE4 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc180J3QNE4 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc180J3QNE4 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc180J3QNE4 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc180J3QNE4 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc180J3QNE4 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc180J3QNE4 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc180J3QNE4 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc180J3QNE4 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc180J3QNE4 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc180J3QNE4 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc180J3QNE4 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc180J3QNE4 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc180J3QNE4 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc180J3QNE4 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc180J3QNE4 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc180J3QNE4 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc180J3QNE4 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc180J3QNE4 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc180J3QNE4 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc180J3QNE4 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc180J3QNE4 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc180J3QNE4 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc180J3QNE4 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc180J3QNE4 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc180J3QNE4 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc180J3QNE4 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc180J3QNE4 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc180J3QNE4 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc180J3QNE4 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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Ccdc180J3QNE4 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
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Ccdc180J3QNE4 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Ccdc180J3QNE4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc180J3QNE4 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms