Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Gm3415J3QMS8 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Gm3415J3QMS8 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Gm3415J3QMS8 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Gm3415J3QMS8 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3415J3QMS8 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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