Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms