Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Sh3tc1G3X9F6 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Sh3tc1G3X9F6 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Sh3tc1G3X9F6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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