Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Gm28048F7BCN0 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Gm28048F7BCN0 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Gm28048F7BCN0 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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