Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Gm17555F6U8B9 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
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Gm17555F6U8B9 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Gm17555F6U8B9 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Gm17555F6U8B9 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Gm17555F6U8B9 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Gm17555F6U8B9 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Gm17555F6U8B9 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Gm17555F6U8B9 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm17555F6U8B9 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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