Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Susd1E9Q3H4 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms