Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ttc17E9PVB5 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Ttc17E9PVB5 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Ttc17E9PVB5 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttc17E9PVB5 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttc17E9PVB5 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttc17E9PVB5 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttc17E9PVB5 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttc17E9PVB5 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttc17E9PVB5 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttc17E9PVB5 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttc17E9PVB5 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttc17E9PVB5 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttc17E9PVB5 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttc17E9PVB5 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttc17E9PVB5 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttc17E9PVB5 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc17E9PVB5 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc17E9PVB5 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc17E9PVB5 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc17E9PVB5 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc17E9PVB5 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc17E9PVB5 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc17E9PVB5 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc17E9PVB5 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc17E9PVB5 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc17E9PVB5 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms