Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
FgaE9PV24 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms