Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms