Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms