Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmf1B9EKI3 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmf1B9EKI3 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmf1B9EKI3 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmf1B9EKI3 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmf1B9EKI3 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmf1B9EKI3 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmf1B9EKI3 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmf1B9EKI3 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmf1B9EKI3 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmf1B9EKI3 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmf1B9EKI3 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmf1B9EKI3 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmf1B9EKI3 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmf1B9EKI3 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmf1B9EKI3 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmf1B9EKI3 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmf1B9EKI3 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmf1B9EKI3 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmf1B9EKI3 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmf1B9EKI3 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmf1B9EKI3 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms