Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
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Trabd2bB1ATG9 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Trabd2bB1ATG9 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Trabd2bB1ATG9 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Trabd2bB1ATG9 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Trabd2bB1ATG9 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Trabd2bB1ATG9 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trabd2bB1ATG9 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Trabd2bB1ATG9 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
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