Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms