Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Odf2A3KGV1 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms