Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atp8b5A3FIN4 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms