Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms