Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SetxA2AKX3 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SetxA2AKX3 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SetxA2AKX3 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SetxA2AKX3 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SetxA2AKX3 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SetxA2AKX3 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SetxA2AKX3 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SetxA2AKX3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SetxA2AKX3 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SetxA2AKX3 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SetxA2AKX3 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SetxA2AKX3 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SetxA2AKX3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SetxA2AKX3 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SetxA2AKX3 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SetxA2AKX3 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SetxA2AKX3 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SetxA2AKX3 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SetxA2AKX3 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SetxA2AKX3 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SetxA2AKX3 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SetxA2AKX3 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SetxA2AKX3 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SetxA2AKX3 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SetxA2AKX3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SetxA2AKX3 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SetxA2AKX3 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SetxA2AKX3 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SetxA2AKX3 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SetxA2AKX3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SetxA2AKX3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SetxA2AKX3 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SetxA2AKX3 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SetxA2AKX3 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SetxA2AKX3 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SetxA2AKX3 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SetxA2AKX3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SetxA2AKX3 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SetxA2AKX3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SetxA2AKX3 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SetxA2AKX3 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SetxA2AKX3 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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SetxA2AKX3 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SetxA2AKX3 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SetxA2AKX3 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SetxA2AKX3 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SetxA2AKX3 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SetxA2AKX3 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SetxA2AKX3 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SetxA2AKX3 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SetxA2AKX3 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SetxA2AKX3 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SetxA2AKX3 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SetxA2AKX3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SetxA2AKX3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SetxA2AKX3 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SetxA2AKX3 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SetxA2AKX3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SetxA2AKX3 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
SetxA2AKX3 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SetxA2AKX3 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SetxA2AKX3 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SetxA2AKX3 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
SetxA2AKX3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SetxA2AKX3 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SetxA2AKX3 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SetxA2AKX3 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SetxA2AKX3 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SetxA2AKX3 Gm22388-201ENSMUST00000158194 248 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SetxA2AKX3 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SetxA2AKX3 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SetxA2AKX3 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SetxA2AKX3 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SetxA2AKX3 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SetxA2AKX3 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SetxA2AKX3 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SetxA2AKX3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SetxA2AKX3 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SetxA2AKX3 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SetxA2AKX3 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SetxA2AKX3 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SetxA2AKX3 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SetxA2AKX3 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SetxA2AKX3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SetxA2AKX3 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SetxA2AKX3 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SetxA2AKX3 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SetxA2AKX3 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SetxA2AKX3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SetxA2AKX3 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SetxA2AKX3 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SetxA2AKX3 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SetxA2AKX3 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SetxA2AKX3 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SetxA2AKX3 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SetxA2AKX3 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SetxA2AKX3 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SetxA2AKX3 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
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