Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Gm8768-201ENSMUST00000220020 826 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Frmpd1A2AKB4 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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