Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17190V9GX38 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17190V9GX38 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17190V9GX38 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17190V9GX38 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17190V9GX38 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17190V9GX38 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms