Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Gm34923-201ENSMUST00000222673 5043 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Celsr3-201ENSMUST00000024238 11547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mbd2Q9Z2E1 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms