Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd3Q9Z2D8 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms