Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
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Lgr5Q9Z1P4 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
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Lgr5Q9Z1P4 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Lgr5Q9Z1P4 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Lgr5Q9Z1P4 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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