Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cpne6Q9Z140 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms