Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cldn13Q9Z0S4 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
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