Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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