Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

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Length 917 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ercc4Q9QZD4 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Ercc4Q9QZD4 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Ercc4Q9QZD4 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Ercc4Q9QZD4 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Ercc4Q9QZD4 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Ercc4Q9QZD4 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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