Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnnt3Q9QZ47 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms