Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm8902-201ENSMUST00000174341 1096 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm28054-201ENSMUST00000187280 872 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 9230110F15Rik-201ENSMUST00000054175 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Olfr1441-201ENSMUST00000059033 1088 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Olfr870-201ENSMUST00000086476 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Speer4c-201ENSMUST00000095005 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Speer4d-201ENSMUST00000095006 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm26909-201ENSMUST00000181668 627 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm28438-201ENSMUST00000188299 345 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 B230110G15Rik-201ENSMUST00000190868 772 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm36966-201ENSMUST00000192217 413 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm37631-201ENSMUST00000192275 364 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Olfr724-202ENSMUST00000213390 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrfQ9JM73 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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